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論文

Electrostatic potential of nucleotide-free protein is sufficient for discrimination between adenine and guanine-specific binding sites

Basu, G.*; Sivanesan, D.*; 川端 猛*; 郷 信広

Journal of Molecular Biology, 342(3), p.1053 - 1066, 2004/09

 被引用回数:23 パーセンタイル:35.48(Biochemistry & Molecular Biology)

非常に多くのたんぱく質が、機能発現のためにアデニンあるいはグアニンを結合する。これらのたんぱく質は、多くの共通の性質を持つにもかかわらず、しばしば明確にアデニンとグアニンを識別する。われわれはこの識別の物理化学的仕組みを解明するために、データベース中にあるこれらのたんぱく質について、それらのアデニン/グアニン結合部位の静電ポテンシャルを計算し、解析した。その結果、静電ポテンシャルのパターンだけで、たんぱく質のアデニン/グアニン識別能を判定できることを示すことができた。

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